Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms