Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCAN3Q9UKA8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms