Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms