Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSKSQ9UJT2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSKSQ9UJT2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms