Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms