Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms