Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms