Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBK1Q9UHD2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBK1Q9UHD2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms