Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms