Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APEX2Q9UBZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms