Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms