Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms