Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-18Q9QC07 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms