Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms