Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
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