Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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