Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXL2Q9NZ53 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXL2Q9NZ53 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms