Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms