Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDAP2Q9NXN4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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