Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms