Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC4Q9NTJ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms