Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms