Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms