Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms