Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS4Q9NRS4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms