Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms