Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASCL3Q9NQ33 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms