Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms