Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRMS1Q9HCU9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms