Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTD2Q9H8S5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms