Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms