Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF41Q9H4P4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms