Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms