Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX4Q9H1E5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX4Q9H1E5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms