Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms