Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms