Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms