Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms