Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms