Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms