Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms