Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms