Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms