Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf70Q9BSU1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms