Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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