Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM29Q9BSF4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms