Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A3Q9BRY0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms