Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARP6Q9BRS8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms