Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms