Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms